Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SOBPA7XYQ1 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SOBPA7XYQ1 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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