Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SH3BP4Q9P0V3 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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SH3BP4Q9P0V3 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SH3BP4Q9P0V3 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SH3BP4Q9P0V3 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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