Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM5Q9C035 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM5Q9C035 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM5Q9C035 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM5Q9C035 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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TRIM5Q9C035 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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TRIM5Q9C035 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM5Q9C035 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRIM5Q9C035 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRIM5Q9C035 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRIM5Q9C035 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRIM5Q9C035 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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TRIM5Q9C035 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRIM5Q9C035 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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TRIM5Q9C035 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
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TRIM5Q9C035 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRIM5Q9C035 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRIM5Q9C035 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRIM5Q9C035 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRIM5Q9C035 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRIM5Q9C035 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRIM5Q9C035 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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