Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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FOXQ1Q9C009 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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FOXQ1Q9C009 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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FOXQ1Q9C009 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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FOXQ1Q9C009 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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FOXQ1Q9C009 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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