Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPOCK3Q9BQ16 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPOCK3Q9BQ16 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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