Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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VGLL1Q99990 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VGLL1Q99990 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
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VGLL1Q99990 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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VGLL1Q99990 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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VGLL1Q99990 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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VGLL1Q99990 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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VGLL1Q99990 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VGLL1Q99990 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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VGLL1Q99990 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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VGLL1Q99990 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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VGLL1Q99990 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
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VGLL1Q99990 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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