Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SEC22AQ96IW7 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
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SEC22AQ96IW7 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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SEC22AQ96IW7 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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SEC22AQ96IW7 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SEC22AQ96IW7 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SEC22AQ96IW7 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SEC22AQ96IW7 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SEC22AQ96IW7 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SEC22AQ96IW7 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SEC22AQ96IW7 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SEC22AQ96IW7 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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