Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SSC4DQ8WTU2 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSC4DQ8WTU2 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms