Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C1orf140Q5VVS0 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C1orf140Q5VVS0 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms