Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KCNMB1Q16558 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms