Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK4Q16099 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK4Q16099 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK4Q16099 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.7 ms