Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USF2Q15853 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USF2Q15853 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USF2Q15853 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USF2Q15853 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USF2Q15853 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
USF2Q15853 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
USF2Q15853 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
USF2Q15853 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
USF2Q15853 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
USF2Q15853 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USF2Q15853 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
USF2Q15853 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USF2Q15853 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
USF2Q15853 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
USF2Q15853 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USF2Q15853 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USF2Q15853 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USF2Q15853 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USF2Q15853 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USF2Q15853 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USF2Q15853 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
USF2Q15853 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
USF2Q15853 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
USF2Q15853 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
USF2Q15853 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
USF2Q15853 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
USF2Q15853 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
USF2Q15853 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
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