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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
MIR548E-201
ENST00000408287
88 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.630-201
ENST00000411370
108 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
MIR5589-201
ENST00000579442
60 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
DLEU2_3.1-201
ENST00000620005
73 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
AL035470.1-201
ENST00000622571
220 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.170-201
ENST00000363746
110 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.353-201
ENST00000365440
108 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.555-201
ENST00000384673
110 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
SNORA13-201
ENST00000458790
133 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU7-200P-201
ENST00000516105
62 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
MIR4280-201
ENST00000582178
76 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
AL157777.2-201
ENST00000258070
137 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.150-201
ENST00000363562
102 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
MIR582-201
ENST00000365731
98 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.464-201
ENST00000384282
110 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
SNORA40-201
ENST00000388090
126 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
AL445193.1-201
ENST00000441183
141 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU7-85P-201
ENST00000458851
63 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNA5SP272-201
ENST00000516095
111 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-65P-201
ENST00000516332
98 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
MIR6851-201
ENST00000617060
67 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-1184P-201
ENST00000384588
108 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.681-201
ENST00000516445
113 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
AL513043.2-201
ENST00000573941
143 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
MIR4536-1-201
ENST00000583537
88 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-86P-201
ENST00000606534
107 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-973P-201
ENST00000364690
107 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.568-201
ENST00000384742
113 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
AC068339.1-201
ENST00000526965
141 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
MIR4636-201
ENST00000582271
80 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNY1P5-201
ENST00000383890
115 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-901P-201
ENST00000384593
106 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-257P-201
ENST00000410238
98 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
SNORD42B-201
ENST00000458893
67 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.659-201
ENST00000515994
113 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.712-201
ENST00000517011
92 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-502P-201
ENST00000362419
108 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
Y_RNA.180-201
ENST00000363867
113 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
SNORD45B-201
ENST00000364617
72 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
RNU6-644P-201
ENST00000391155
98 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
snoU13.13-201
ENST00000458842
104 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
MIR3613-201
ENST00000579844
87 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CUL1
Q13616
MIRLET7F1-201
ENST00000362202
87 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
SNORA63.2-201
ENST00000362603
126 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
Y_RNA.220-201
ENST00000364244
109 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
Y_RNA.343-201
ENST00000365354
112 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR204-201
ENST00000385200
110 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
SCARNA20.2-201
ENST00000516052
116 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR3681-201
ENST00000580089
72 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR3914-2-201
ENST00000637339
95 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
Y_RNA.95-201
ENST00000363079
95 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR604-201
ENST00000384880
94 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR548U-201
ENST00000390728
81 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
AC021146.6-201
ENST00000514659
117 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR5009-201
ENST00000578736
100 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU6-132P-201
ENST00000383863
107 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU6-813P-201
ENST00000384691
107 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
Y_RNA.649-201
ENST00000459077
103 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
SNORD38.3-201
ENST00000516599
73 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU6-762P-201
ENST00000517107
102 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR3064-201
ENST00000581130
66 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU6-495P-201
ENST00000362995
107 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
SNORA24B-201
ENST00000384176
131 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU6-476P-201
ENST00000384726
107 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNY1P7-201
ENST00000384743
110 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
Y_RNA.506-201
ENST00000384494
102 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MIR196A1-201
ENST00000388006
70 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU7-24P-201
ENST00000458867
62 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU7-107P-201
ENST00000459121
61 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
AC097510.1-201
ENST00000510945
133 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
U6.95-201
ENST00000636931
70 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
Y_RNA.10-201
ENST00000362371
110 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
RNU6-80P-201
ENST00000384195
107 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
MT-TQ-201
ENST00000387372
72 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
SNORD4B-201
ENST00000459083
72 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
FGF7P7-201
ENST00000514120
227 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
AC104996.3-201
ENST00000590718
94 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CUL1
Q13616
SNORA63.6-201
ENST00000364921
119 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
MIR224-201
ENST00000384889
81 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
IL6ST-207
ENST00000396816
168 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU4-63P-201
ENST00000411313
118 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU6-62P-201
ENST00000516526
102 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU6-881P-201
ENST00000516813
102 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
AC103810.7-201
ENST00000607821
91 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
Y_RNA.586-201
ENST00000391146
98 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU6-1211P-201
ENST00000459179
105 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
Y_RNA.281-201
ENST00000364774
94 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
Y_RNA.484-201
ENST00000384389
103 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
TRAJ57-201
ENST00000390482
63 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU6-721P-201
ENST00000410155
105 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU6-1052P-201
ENST00000411398
104 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
SNORD33.1-201
ENST00000516213
88 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU6-719P-201
ENST00000516671
104 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
AC108676.2-201
ENST00000605225
163 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
MIR6773-201
ENST00000612812
74 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
Y_RNA.68-201
ENST00000362881
102 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
Y_RNA.491-201
ENST00000384417
107 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
MIR518B-201
ENST00000385127
83 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
SNORD75.2-201
ENST00000408784
58 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CUL1
Q13616
RNU6-592P-201
ENST00000411333
103 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
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