Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PEX6Q13608 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PEX6Q13608 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PEX6Q13608 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PEX6Q13608 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PEX6Q13608 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
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PEX6Q13608 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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PEX6Q13608 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PEX6Q13608 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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