Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKD2Q13563 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKD2Q13563 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PKD2Q13563 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKD2Q13563 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKD2Q13563 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKD2Q13563 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKD2Q13563 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PKD2Q13563 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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