Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TOP3AQ13472 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TOP3AQ13472 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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