Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF3B2Q13435 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF3B2Q13435 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF3B2Q13435 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF3B2Q13435 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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