Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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SP140Q13342 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SP140Q13342 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SP140Q13342 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SP140Q13342 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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SP140Q13342 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SP140Q13342 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SP140Q13342 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SP140Q13342 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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SP140Q13342 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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SP140Q13342 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
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SP140Q13342 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SP140Q13342 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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SP140Q13342 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SP140Q13342 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SP140Q13342 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SP140Q13342 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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