Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CLN3Q13286 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLN3Q13286 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLN3Q13286 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLN3Q13286 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.8 ms