Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
GRIN2BQ13224 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.19□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
GRIN2BQ13224 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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GRIN2BQ13224 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2BQ13224 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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