Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHAF1BQ13112 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHAF1BQ13112 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHAF1BQ13112 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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