Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM32Q13049 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM32Q13049 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM32Q13049 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
TRIM32Q13049 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM32Q13049 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM32Q13049 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
TRIM32Q13049 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms