Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
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TFF3Q07654 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
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TFF3Q07654 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
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TFF3Q07654 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
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TFF3Q07654 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
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TFF3Q07654 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
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TFF3Q07654 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
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TFF3Q07654 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
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TFF3Q07654 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-5.17□□□□□ -3.24
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