Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
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PGGT1BP53609 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PGGT1BP53609 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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PGGT1BP53609 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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PGGT1BP53609 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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PGGT1BP53609 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PGGT1BP53609 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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