Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRDMT1O14717 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRDMT1O14717 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRDMT1O14717 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.9 ms