Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP49Q70CQ1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.8 ms