Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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