Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CDO1Q16878 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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CDO1Q16878 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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CDO1Q16878 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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CDO1Q16878 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDO1Q16878 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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CDO1Q16878 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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CDO1Q16878 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CDO1Q16878 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CDO1Q16878 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CDO1Q16878 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CDO1Q16878 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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