Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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PTPRNQ16849 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRNQ16849 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRNQ16849 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRNQ16849 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRNQ16849 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRNQ16849 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRNQ16849 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRNQ16849 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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PTPRNQ16849 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRNQ16849 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRNQ16849 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRNQ16849 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRNQ16849 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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