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Protein–RNA interactions for Protein: Q16586
SGCA, Alpha-sarcoglycan, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SGCA
Q16586
AL442128.1-201
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□□□□□ -2.49
SGCA
Q16586
MIR548AZ-201
ENST00000616567
95 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SGCA
Q16586
MIR20A-201
ENST00000362279
71 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
Y_RNA.391-201
ENST00000383933
94 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU6-1036P-201
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104 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
Y_RNA.400-201
ENST00000383963
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BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
SNORA32.3-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR569-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU6-1057P-201
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR3144-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR4493-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR101-1-201
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU6-664P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
Y_RNA.170-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
Y_RNA.257-201
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102 nt
BASIC
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SGCA
Q16586
Y_RNA.398-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU6-455P-201
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SGCA
Q16586
MIR216B-201
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SGCA
Q16586
RNU6-816P-201
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SGCA
Q16586
RNU6-1268P-201
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU6-1239P-201
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107 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR4696-201
ENST00000581431
70 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
SNORD114-11-201
ENST00000363738
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
Y_RNA.283-201
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112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
SNORD58C-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR196A2-201
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110 nt
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
AC244090.1-201
ENST00000441884
93 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
Y_RNA.696-201
ENST00000516725
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
AC025166.1-201
ENST00000612411
163 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
SYCP2-202
ENST00000371001
5479 nt
APPRIS P2
TSL 1 (best)
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU6-235P-201
ENST00000362644
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
RNU4ATAC9P-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MIR548O2-201
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70 nt
BASIC
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SGCA
Q16586
FTX_2.1-201
ENST00000618816
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BASIC
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SGCA
Q16586
uc_338.36-201
ENST00000622331
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BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
Q16586
MTND5P18-201
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1801 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
SGCA
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RNU6-1125P-201
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BASIC
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ENST00000390509
66 nt
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BASIC
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SGCA
Q16586
RNU6-935P-201
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Q16586
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BASIC
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SGCA
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SGCA
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
AC114755.3-201
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BASIC
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Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
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□□□□□ -2.51
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Q16586
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SGCA
Q16586
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Q16586
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SGCA
Q16586
Y_RNA.346-201
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SGCA
Q16586
RNU6-886P-201
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SGCA
Q16586
RNU6-900P-201
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BASIC
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SGCA
Q16586
RNU6-35P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.51
SGCA
Q16586
MIR604-201
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BASIC
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□□□□□ -2.51
SGCA
Q16586
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Q16586
MIR577-201
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96 nt
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SGCA
Q16586
SNORD75.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.51
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Q16586
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BASIC
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Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
Y_RNA.433-201
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BASIC
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Q16586
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ENST00000386157
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.51
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Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
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BASIC
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Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
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□□□□□ -2.51
SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.51
SGCA
Q16586
RNU6-772P-201
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BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SGCA
Q16586
RNU6-758P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.51
SGCA
Q16586
RNU6-762P-201
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SGCA
Q16586
RNU6-1062P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.52
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Q16586
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BASIC
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Q16586
RNU6-86P-201
ENST00000606534
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
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