Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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KCNMB1Q16558 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
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KCNMB1Q16558 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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KCNMB1Q16558 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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KCNMB1Q16558 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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KCNMB1Q16558 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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KCNMB1Q16558 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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KCNMB1Q16558 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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KCNMB1Q16558 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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KCNMB1Q16558 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KCNMB1Q16558 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KCNMB1Q16558 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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