Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SSX1Q16384 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SSX1Q16384 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SSX1Q16384 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SSX1Q16384 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SSX1Q16384 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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SSX1Q16384 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SSX1Q16384 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SSX1Q16384 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SSX1Q16384 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SSX1Q16384 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SSX1Q16384 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SSX1Q16384 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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