Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SURF1Q15526 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SURF1Q15526 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms