Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NR1I3Q14994 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NR1I3Q14994 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NR1I3Q14994 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NR1I3Q14994 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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