Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD9Q14511 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD9Q14511 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.9 ms