Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
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PKP1Q13835 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKP1Q13835 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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PKP1Q13835 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
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PKP1Q13835 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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PKP1Q13835 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
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PKP1Q13835 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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PKP1Q13835 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PKP1Q13835 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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