Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ALCAMQ13740 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ALCAMQ13740 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ALCAMQ13740 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ALCAMQ13740 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ALCAMQ13740 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ALCAMQ13740 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ALCAMQ13740 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ALCAMQ13740 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ALCAMQ13740 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.9 ms