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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
AC114755.3-201
ENST00000481111
251 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-781P-201
ENST00000516377
101 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR548O2-201
ENST00000616090
70 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR6759-201
ENST00000638110
65 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
SNORD101-201
ENST00000384027
73 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR4696-201
ENST00000581431
70 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR4432-201
ENST00000581823
84 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
AL391099.1-201
ENST00000624635
187 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
AC099654.10-201
ENST00000640395
161 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
hsa-mir-3130-1.1-201
ENST00000579223
75 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR3144-201
ENST00000579460
79 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-664P-201
ENST00000362381
107 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
Y_RNA.155-201
ENST00000363632
101 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
Y_RNA.257-201
ENST00000364596
102 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
SNORD58C-201
ENST00000365223
64 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR1912-201
ENST00000410389
80 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
SYCP2-202
ENST00000371001
5479 nt
APPRIS P2
TSL 1 (best)
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-1125P-201
ENST00000363601
107 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
Y_RNA.185-201
ENST00000363894
100 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
Y_RNA.283-201
ENST00000364798
112 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR9-2-201
ENST00000384838
87 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-935P-201
ENST00000410371
100 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-804P-201
ENST00000384286
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-455P-201
ENST00000384681
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
TRAJ28-201
ENST00000390509
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-816P-201
ENST00000390914
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-1268P-201
ENST00000391214
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-1239P-201
ENST00000391310
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
Y_RNA.648-201
ENST00000459455
110 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU4ATAC9P-201
ENST00000517146
126 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNA5SP66-201
ENST00000517178
101 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
AC025166.1-201
ENST00000612411
163 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
Y_RNA.398-201
ENST00000383952
99 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-1036P-201
ENST00000383959
104 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
SNORD75.1-201
ENST00000408373
60 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
Y_RNA.677-201
ENST00000516401
85 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-1057P-201
ENST00000517162
102 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
AL353621.2-201
ENST00000605340
133 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
Y_RNA.437-201
ENST00000384113
113 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-900P-201
ENST00000384498
102 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
U3.27-201
ENST00000391237
200 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
SCARNA17.3-201
ENST00000516381
125 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-182P-201
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105 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
AP001180.6-201
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159 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MIR4436A-201
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85 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
AC096720.1-201
ENST00000604441
183 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MTND5P18-201
ENST00000445624
1801 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-1244P-201
ENST00000363614
108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-1162P-201
ENST00000384443
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
SNORD2-201
ENST00000459163
69 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MIR4679-2-201
ENST00000578358
77 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
Y_RNA.30-201
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97 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
SNORA49-201
ENST00000386157
136 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-75P-201
ENST00000515944
104 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MIR4694-201
ENST00000578534
80 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MIR4802-201
ENST00000581881
80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
ZNRD1-AS1_1.6-201
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BASIC
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CUL1
Q13616
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ENST00000610631
239 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MIR101-1-201
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75 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
Y_RNA.346-201
ENST00000365385
112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
Y_RNA.549-201
ENST00000384657
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BASIC
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CUL1
Q13616
AC093726.3-201
ENST00000637588
150 nt
BASIC
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CUL1
Q13616
Y_RNA.309-201
ENST00000365046
111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
RNU6-886P-201
ENST00000384319
105 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
MIR577-201
ENST00000385196
96 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
AC090616.3-202
ENST00000583346
205 nt
TSL 2
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
CUL1
Q13616
SNORD114-14-201
ENST00000362723
75 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.488-201
ENST00000384403
102 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.601-201
ENST00000410500
113 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU7-55P-201
ENST00000459426
62 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNA5SP169-201
ENST00000517268
117 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.8-201
ENST00000362353
102 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
SNORD115-25-201
ENST00000362619
82 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.239-201
ENST00000364444
113 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
MIR451A-201
ENST00000385059
72 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
SNORA3B-201
ENST00000391305
131 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-426P-201
ENST00000516464
97 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
SNORA40.17-201
ENST00000517256
115 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
MTND5P41-201
ENST00000517498
206 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
MIR4439-201
ENST00000583746
80 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
MIR4493-201
ENST00000584016
73 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
SNORD114-4-201
ENST00000363962
75 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
SNORD50.2-201
ENST00000365465
70 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
MTND4LP9-201
ENST00000427694
174 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-832P-201
ENST00000363319
107 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.163-201
ENST00000363702
113 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
SNORD56B-201
ENST00000384713
71 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-772P-201
ENST00000516042
105 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
AP000676.1-201
ENST00000533307
52 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
AC025521.1-201
ENST00000621624
286 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNY3P2-201
ENST00000362918
102 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
Y_RNA.371-201
ENST00000365591
113 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-1062P-201
ENST00000383908
107 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNA5SP451-201
ENST00000410588
110 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-1133P-201
ENST00000410963
100 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-1212P-201
ENST00000517023
104 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
CUL1
Q13616
RNU6-54P-201
ENST00000365563
107 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
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