Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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RIPK1Q13546 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIPK1Q13546 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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RIPK1Q13546 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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RIPK1Q13546 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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RIPK1Q13546 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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