Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TOP3AQ13472 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TOP3AQ13472 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TOP3AQ13472 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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