Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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