Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3BQ13214 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3BQ13214 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEMA3BQ13214 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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