Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
MKRN3Q13064 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MKRN3Q13064 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MKRN3Q13064 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MKRN3Q13064 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MKRN3Q13064 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MKRN3Q13064 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MKRN3Q13064 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MKRN3Q13064 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN3Q13064 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN3Q13064 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MKRN3Q13064 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MKRN3Q13064 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MKRN3Q13064 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MKRN3Q13064 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MKRN3Q13064 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MKRN3Q13064 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MKRN3Q13064 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MKRN3Q13064 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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