Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIAQ12857 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIAQ12857 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.4 ms