Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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PGGT1BP53609 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PGGT1BP53609 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PGGT1BP53609 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PGGT1BP53609 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PGGT1BP53609 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PGGT1BP53609 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PGGT1BP53609 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PGGT1BP53609 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PGGT1BP53609 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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PGGT1BP53609 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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PGGT1BP53609 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PGGT1BP53609 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PGGT1BP53609 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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PGGT1BP53609 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PGGT1BP53609 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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