Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SCN11AQ9UI33 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN11AQ9UI33 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
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