Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
FAM53CQ9NYF3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.3 ms