Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRERF1Q96PN7 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRERF1Q96PN7 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRERF1Q96PN7 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRERF1Q96PN7 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRERF1Q96PN7 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRERF1Q96PN7 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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TRERF1Q96PN7 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRERF1Q96PN7 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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