Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms