Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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